当导热油锅炉系统运行很长时间后，导热油的粘度、闪点、残碳、酸值会超标，直接影响系统的正常运行，此时就应该及时清洗确保安全。常用的清洗方法有三种：
在线清洗(清洗剂为有机清洗剂)：此清洗方法是把清洗剂混入系统中，进行缓慢清洗，周期较长，一般是三个月以上，优点是不停工清洗，缺点是清洗下来的残碳仍随油品流动，不能从系统去除，时间一久就又沉积在管线设备表面，这种清洗方法适用于短期因生产任务紧张不能停工的情况下使用。
溶剂清洗(清洗剂为溶剂清洗剂)：此种清洗方法目前是国内外广泛使用的，而且安全可靠。这种清洗剂是一种渗透性极强的有机物，油溶性强，能有效清除系统中的油泥、残碳，清洗时间短，而且不需要升温处理，直接加入系统循环几个小时就可随油一起排放，安全环保无风险。
水基清洗(清洗剂为有机清洗剂)：此类清洗剂需要在导热油锅炉整个系统发生严重积碳时使用，其使用方法是把系统导热油排出后，加入有机清洗剂，再加入工业水，启动循环泵，点燃锅炉升至一定温度，时间比较长，一般24-48小时左右。该清洗的优点是能把系统的油泥、残碳包括碳化的石墨碳清除，缺点是清洗的废水处理比较麻烦，同时，当再次开动系统升温时，因有大量水分存在，升温时间较长，生产成本上升。
